Le territoire du Grand Pic Saint-Loup abrite quatre sites Natura 2000 : 3 en directive "Habitats" et 1 en directive "Oiseaux". La Communauté de communes du Grand Pic Saint-Loup est animatrice de deux de ces sites.
- Site Natura 2000 "Pic Saint-Loup"
Code : ZSC FR9101389 / Habitats
Animateur : Communauté de communes du Grand Pic Saint-Loup - Site Natura 2000 "Hautes Garrigues du Montpelliérais"
Code : ZPS FR9112004 / Oiseaux
Animateur : Communauté de communes du Grand Pic Saint-Loup - Site Natura 2000 "Gorges de l'Hérault"
Code : ZSC FR9101388 / Habitats
Animateur : Communauté de communes Vallée de l’Hérault (+ d'infos) - Site Natura 2000 "Le Lez"
Code : ZSC FR9101392 / Habitats
Animateur : Syndicat du Bassin du Lez - SYBLE (+ d'infos)
